Pour les interventions chirurgicales, ou pour les pathologies malignes le gastro-entérologue oriente le patient ou travaille en collaboration avec le chirurgien digestif et/ou l’oncologue. Notons que la gastro-entérologie englobe deux principales sous-spécialités (que certains médecins exercent spécifiquement) : l’hépatologie (qui concerne les pathologies du foie) et la proctologie (qui s’intéresse aux pathologies de l’anus et du rectum). La discipline s’intéresse ainsi à différents organes (l’œsophage, l’intestin grêle, le côlon, le rectum, l’anus), mais aussi aux glandes digestives (le foie, les voies biliaires, le pancréas). La gastro-entérologie est la spécialité médicale qui se consacre à l’étude de l’appareil digestif, à ses troubles et anomalies, ainsi qu’à leur traitement.
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